Ještě jsem trochu hledal a myslím, že bych mohl zkusit tohle.


Pokud Windows spouští při svém startu kromě služeb i větší množství programů, nezobrazují se ikony v tray správně. Měl jsem také tento problém a vyřešil jsem ho instalací free programu Startup Delayer. Spouštění programů jsem tak rozdělil: důležitější zůstaly na krku systému (antiwir, antispyware, firewall, Skype a další) a ty méně důležité spouští se zpožděním výše zmíněný program. Od té doby NO problem.