PATA a SATA je (resp. by malo byt ak sa nemylim) z hladiska software to iste. Problem je len ten, ze SATA je zvycajne druhy radic (a teda je v nativnom mode a nie na standardnych I/O portoch atd). To sa da ale ovplyvnit v BIOSe nastavenim SATA controllera do compatible modu (nie Native).
Skusil si spustaciu disketu Win98 a zvolit pri bootovani ze "s podporou CDROM"? Ak to nejde so SATA v nativnom mode tak skusit v BIOSe prepnut SATA do legacy (compatible) modu.

p.S. to "nesnese se s ghostem" - nie je to nahodou tym ze ghost tam leze nie cez ovladace, a teda bude fungovat aj tak len vtedy ak bude SATA kontroller prepnuty na legacy (compatible), bez ohladu na nejake ovladace?