Po tom jsem taky pátral, a někdo mi říkal, že titulky by měly jít přidat přes Nero ShowTime se zapnutým některým filtrem v ffdshow kodecích (tam se zadává i cesta k titulkům). Zkoušel jsem to, ale nepodařilo se mi to. Možná nějak zjistíš, jak na to. Výsledný soubor potom ale není přímo mpeg, ale mpeg2 DVD.

Edit: Když občas něco sestříhám v Neru a výsledek uložím jako Image a potom z toho chci dostat mpeg, načtu Image do Daemona a v Neru zvolím Vytvořit vlastní DVD video a vyberu si vytvořenou virtuální jednotku. Video se potom dekóduje na mpeg do zvolené složky (nutno nechat ještě analyzovat, jinak se video vymaže), zavřu Nero a mpeg soubor mi zůstane. Není to zrovna nejpohodlnější řešení, ale mně to stačí.