Myslím že se to nastavení podle disků samo měnit nebude ať tam máš jeden nebo 6.už kvůli těm problémlm s win.
Ahci to možná umí ale nenašel jsem ovladač. Ten standardní na ich 7r-9r nejel. Windows si to v tom "ahci" režimu nenašli ale linux ten disk našel. Nech to na té emulaci.
Když měníš ahci nebo emulovaný ide tak se struktura dat na disku nijak nemění. Jde jen o to jestli naskočí windows nebo se hryznou na tom že při strartu nenajdou disk díky změně řadiče.