Co se týká zálohy běžícího linuxu (v podstatě té karty s OS):

1) Nemusí být příliš častá, pokud ti nejde o logy. Je třeba ji udělat v podstatě jen po aktualizacích.
2) Nejjednodušeji bych to viděl na dd prvních 512B (MBR a partisn tabulka) a pak tar všeho ostatního s vyjmutím systémem generovaných adresářů adresářů (/dev /proc) a logů (/var/log).
3) Souborově (případně přes tar, pokud je třeba zachovat práva a záloha se provádí do "nelinux" filesystému) pak zálohovat čistě data.

Obnova by pak znamenala zpět dd prvních 512B a následné rozbalení taru