Nemam ted cas, snad pomuze nekdo jiny, ale rychle natuknuti:

I na Ubuntu to funguje stejne jako popsal Rce, neco delas spatne, kdyz das to manualni vytvoreni oddilu, tak tam mas moznost, formatovat "/" a swap a "/home" jenom pripojit bez formatovani, zustanou teda stara data.

Nicmene to co popisujes, tak bych tipl, ze problem bude v nejakem konfiguraku pritomnem prave v "/home", tudiz preinstalace nemusi pomoct.

Nabootuj stary system, prepni se do terminalu, prihlas se pres terminal a vyres problem. Pripadne pokud v terminalu neumis, tak nainstaluj jine graficke prostredi nez Unity, prepni se do nej, prihlas se a vyres problem s konfigurakama Unity. (Na ceskem ubuntu foru (forum.ubuntu.cz) by ti mohli poradit presneji, budou vedet, ktere konfiguraky nejspis smazat.)