Prostě to, co potřebuješ zálohovat, zkopíruj na dvě fyzicky různý média a basta fidli. Čas od času zkontroluj, jestli to jde přečíst (pokud ne, zakup nový médium a zkopíruj to z orignálu nebo z té první funkční kopie) a to je vše.
Já to takhle dělám už přes 20 let a ještě jsem o nic nepřišel (od toho je záloha na dvou fyzicky různých médiích), ani se mi u ničeho nezhoršila kvalita (úplná blbost). Prostě to buď jde přečíst (pak je to bitově stejné), nebo nejde (protože se třeba na disku objevila chyba), nic mezi tím. Nic jako MD5 řešit nemusíš.