Zkoušel.
Tímto způsobem jsem odemykal zamknuté (ne zašifrované) Excely pro úpravy - podstrčil jsem do ZIP jiný soubor.

Zkoušel jsem to teď. Pokud soubor vytáhnu, nahradím a vrátím zpět (necham zip, jak je), tak to projde.
Pokud ZIP rozbalim a pak znovu zabalim, pak to neprojde - neznám parametry. To znamená, že musíš ZIP zabalit se stejnými parametry (typ komprese atd.) jako původní

P.S.
Tak se mi podařilo zavalit i rozbaleny XLSX
Použil jsem 7Zip, jako metoda ZIP, fastest, deflate
Jen nesmíš do archivu zabalit i nadřízenou složku