... OS se nainstaloval na SSD. ( aktuálně beru HDD jako druhotnou věc )...

Jen Bůh a Bill ví, jestli si Windows při instalaci na SSD nezapsaly nějaká data nutná pro spuštění i na klasický HDD...
Měl jsi při instalaci ten HDD odpojit, pak bys měl jistotu, že na něm nic důležitého není. Zjistíš to tak, jak už bylo řečeno - odpojíš ten HDD a zkusíš nabootovat z SSD