Souřadnice bodu na kružnici pro daný střed (x0, y0) úhel (alfa) a poloměr kružnice (r) máš zde:
Stačí dosadit.
edit: maximálně bude třeba "pootočit" úhel, pokud je logika kreslení příkazu Arc jiná, než u goniometrických funkcí (nevím, JavaFX neznám, tak na to raději upozorním)