Za mě:
- jedno "téma", jeden TC kontejner, MEGA. Záleží samozřejmě na velikosti dat, pro nižší jednotky GB to není takový problém s případnými downloady/uploady.
- průběžné zálohy, tedy relativně častěji (týdně? měsíčně?), další TC kontejnery, ve kterých jsou jen změny
- čas od času nový kompletní TC kontejner pro měnící se data (pro fotky ne, tam stačí přírůstky).
Ano, není to pohodlné. Ale to je daň za TC.

TC se dá nahradit třeba 7z (či jiným), nepohodlí zůstává, bezpečnost klesá. Na samotné šifrování MEGA či čehokoliv jiného bych určitě nespoléhal.

Oficiální cloudy (Google, OneDrive atd) nepoužívám. A nikdy bych nepoužil ukládání nezašifrovaných souborů někam, takové to "pracujte se svými daty všude a kdykoliv".