bezpečné uložení dat

Hard Disk Low Level Format Tool
Maže zavádzacie dáta na prvom sektore a formátuje strojovým kódom 0-1

na bezpečné vyrvatie flešky/exterňáša z portu je tu v rohu ikona s bublinami:
http://www.safelyremove.com/index.htm

Vtip není v "bezpečném" uložení, ale v zálohování s vypracovanou politikou (četnost záloh, jejich ověřování přes hash, distribuci záloh kvůli krádeži či požáru, šifrování citlivých dat, ověřování zpětného načtení atd.)

Flešdisk je spotřebák, tam není zaručeno naprosto nic. Pořiď si rozumnější x-tou zálohu, např. kvalitní DVD-RAM. Nebo TrueCrypt kontejner někde v cloudu.

problémy s flashkou nejsou nikdy způsobené jejím vadným formátováním, ale vždy vadným chováním buď uživatele, nebo diskové cache windows.
takže pokud tvým jediným zálohovacím médiem je usb disk (nebo dokonce usb flashka), už teď jsi o ty data prakticky přišel.

nějaký program s přívětivím prostředím pro znovu otevření souboru

jestli před úpravami nekopíruješ soubory z flashky na bezpečný disk, ale rovnou je edituješ z flashky, nepomůže ti ani zaříkávání.
jednak se nevytváří přirozená záloha na druhém místě (v nejhorším o jednu generaci úprav starší), druhak u flashky coby nespolehlivého média (+ ta cache) o to více hrozí poškození souborového systému, prakticky znefunkčnění flashky.