Tady jsem nasel nejake reseni pomoci skriptu:
http://mygreenpaste.blogspot.com/2007/05/setting-pr iority-of-service-process-via.html
Pomoci registru muzes vyzkouset tohle:
HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet \Services\wuauserv
vytvor novou DWORD PriorityClass
a nastav ji hodnotu asi 3. Hodnota je od 1 do 9, takze 5 je normalni.