Skôr vidím problém v zálohe systémového oddielu, ktorý sa spraví live, za behu OS. V tom prípade na naruší obnova metadát, lebo tá sa neustále mení, zapisuje sa systémom na disk.
Acronis běžně zálohuje za běhu Windows (nevím jak to dělá) a s obnovou není problém.