acronis je nainstalovaý (problematická možnost) nebo souštěný jen z boot média? ve druhém případě to totiž nikdy nedělá.
potom záleží, co všechno je v záloze, které systémové oddíly a co je vynechané.

záloha/obnova používá nějakou acronis security zone?

ve správě disků to vypadá normálně?

v msconfig.exe - boot: je vidět, na který bootloader je nastaven start systému?