Zjevně jsou pryč systémové soubory, možná boot sekce... Nevím, každopádně bych tam vložil instal DVD nebo nabootoval do recovery a zkusil automatickou opravu Windows. Když by to neklaplo, tak bych věřil jen reinstalaci.
Nevím, na co ten program slouží, ale že zkušenosti vím, ze všelijaké čističe páchají jen zlo.