mysql_dump - vypises si zvlast strukturu, zvlast data (pripadne se strukturama) do textovych souboru, ty pak porovnas cimkoli na porovnavani textovych souboru.
Data asi budes chtit dumpnout po jednom zaznamu na radek, pokud ti ta aplikace prida nejake sloupecky, tak at vidis zmenu jako sloupec, nikoli jen, ze se data lisi.