Je na té flashce vůbec nějaké volné místo pro převod?Ale nic nepřeváděj a kopíruj data postupně.Když jsi je pod FAT32 nahrál,nepotřebuješ teď NTFS.
Nějaký antivir přitom běží?Zkus nabootovat nějaký live Linux a kopírovat z něho.Nebo zkus program Recuva,je zdarma.