V BIOS jde někdy určitý disk upřesnit jako "Hot plug" což ti umožní ho odpojit během chodu, nebo "External Sata", tak ho pak můžeš pod Windows bezpečně vysunout.
Tak když ti nic z uvedených odpovědi nepomůže, tak to zkus.
(vycházím z toho, že jde o normální HDD bez nějakých systémových oddílů)