... Začínám skenovat, ale musím před každým skenem složitě se proklikávat k úkonu ... lze nějakým programem, nebo v samotném zařízení nastavit tak že jen budu obracet listy a skenovat bude automaticky?

Presne tak. Obrátim list+ťuknem prstom ... obrátim list+ťuknem prstom a takto dookola 100 krát. Žiadne zložité preklikávanie k úkonu, To rozdelenie dvojstran je na konci iba bonus toho softvéru.