ALT+X a následovně Y + Enter jako YES pro potvrzení a Enter pro uložení.
Mně to funguje, a změna je uložena. Počítám s tim, ze jsi to spuštěl jako sudo :

(Nebo službu Thunderbird nejdrive vypni / kill. Jestli ji nemáš v automatickém spuštění po startu, tak jen vypni zapni PC a udělej to znova bez toho, aniž by byl Thunderbrid spuštěný v pozadí )