A cílem je co ? Chceš to prodat, nechceš aby se někdo hrabal v datech ?= Potřebuješ program co oba disky přepíše.
https://www.idnes.cz/technet/software/bezpecne-smazani-dat.A190202_192841_software_dvr

Chceš to jen pro sebe celé vymazat - odpojíš disk D, zahájíš instalaci při té naformátuješ disk C. Po nainstalování windows, ovladačů připojíš disk D a u toho pak zvolíš naformátovat.
Dá se to i zkombinovat s 1) ale nemá moc smysl.