Nemusíš nič odpojovať, samé blbosti.
Po načítaní bútovacej flešky si najprv otvor príkazový riadok cmd.exe, v ktorom nalistuješ nástroj Diskpart.exe. Príkazmi Clean zmaž nulté sektory na oboch pevných diskoch, čím sa nadobro zmažú sektory s údajmi o HW, oddieloch, dátach a Biose, ktoré nechceš. Je to v prípade, ak by si mal náhodou zavázadcí oddiel na druhom hdd.
Na fleš SSD-čku bude po čistej inštalácii zavádzací sektor, teda na SSD bude aktívny a primárny oddiel spolu s Windows ak normálne zvolíš čistú inštaláciu. V prípade x64 bit. systému si tento vytvorí pri inštalácii aktívny oddiel s kapacitou cca 350MiB, ktorý je bez priradeného písmena v gr.prostredí Windows na ktorom je situovaný výhradne zavádzač spolu s bootmanažérom.
Na písmene pod C:\ bude na SSD disku samotný Windows spolu so zavádzacím sektorom a bútmanažérom.
Sekundárny hdd inštalátor W10 nebude brát v potaz, Inštalátor mu automaticky priradí voľné písmeno, zrejme D:\ a označí ho ako logický, primárny disk s voľným oddielom celej jeho kapacity.