Tak to netuším. Třeba ten program používá jiné kódování, který diakritiku neumí, ale to je jen domněnka. Teď už to stejně nenapravíš použitím jiné aplikace, která by to mohla umět.
Program, který by to uměl včetně diakritiky neznám, ale možná někdo bude vědět. Zkopírování těch souborů ze zálohy nebude trvat déle, než obnova.