MBR a GPT je jenom záznam na začátku disku jak jsou na něm vytvořeny oddíly. V případě GPT ještě kopie. Nic jiného se nemění, nezapisují se data jinak.
Není problém si to přehodit podle potřeby.
EDIT: Ten GPT ale zabere víc místa na začátku disku. Z hlediska kapacity naprosté hovno ale mohlo to způsobit rozhození Acronicsu který oddíl blbě obnovil.

První verze co mě napadá SSD v háji.
Druhá verze rozhodil jsi nějak oddíl, není zarovnaný. Stručně dřív byl sektor na HDD o velikosti 512, klasické HDD to emuluji, SSD potřebují mít začátky a velikosti partition dělitelné 4096.
Zkus to pomocí tohoto https://www.partitionwizard.com/partitionmanager/how-to-align-ssd-partition.html Viz obrázky.

Osobně bych obnovil zálohu na jiný disk ať máš klid.
To smetí smazal pokud máš zálohu - evidentně se to nezdařilo nemá cenu s tím ztrácet čas nikdy nebudeš vědět co je poškozené.
Zkusil SSD nějakým testem nebo na něj jnapř. nainstaloval OS.
Obnovil znovu zálohu na SSD.

Tak mě napadá to je FAT32 ? Podle těch rozesraných názvů souborů u ntfs sem to ještě neviděl.