to jsem tam nenapsal: problém code39 a code128 je v tom, že:

1. code39 neobsahuje všechny znaky ASCII
2. code39 i code128 jsou poměrně rozměrově náročné. Delší text bude mít za následek poměrně dlouhý kód, který zase bude muset být velký, aby byl čitelný z velké vzdálenosti, kterou čtečka zvládne

Jen připomínám, že QR za určitých (poměrně lehkých) podmínek zvládá i češtinu.

Cestu bych v souboru naopak považoval za plus, protože pak lze dokumenty skladovat v příslušných složkách (případy, pacienti, projekty, apod.), což zase umožňuje alespoň základní orientaci a práci v případě výpadku čtečky. Připomínám, že tazatel podle dotazu velmi pravděpodobně žádný IS nemá.