Jestli spoustíš instalaci z plochy, tak máš určitě v programech Gparted, ten formát tomo eMMC proveď přes něho.
(postupně všechny oddíly smažeš, dáš potvrdit, a následovně klikneš na "NEW" - vytvořit nový oddíl → EXT4 a opět uložit změny )

Až budes mít úložiště nachystané tak až teprve potom spusť instalaci.
https://gparted.org/display-doc.php?name=help-manual&lang=cs