Můžeš zkusit jedinou věc - převzít vlastnictví těch souborů, odebrat všem mimo sobě práva na zápis, nechat pouze právo ke čtení. Uvidíš, zda si program práva upraví něco zda update spadne.
Další věc je, napsat utilitu, která soubory otevře pro zápis a bude je "držet". Budeš ji spouštět v dávce s tím programem.