CPU běží na 90% jako by se v pozadí spouštěl nějaký program. Ve správci úloh ale nic není.

To je nepravděpodobné. Ve Správci úloh přejdi na kartu Procesy, nech si je seřadit podle položky Procesor (kliknutím na ouško Procesor) a uvidíš, co těch 90% CPU využívá. Případně sem dej screeen těch seřazených procesů.