Pokud chceš šifrovat flešku, já osobně z vlastní zkušenosti doporučuji šifrovací program VeraCrypt (dříve TrueCrypt). Je to program zdarma. pro Windows je i česky atd.. Můžeš si udělat buď zašifrovaný soubor třeba o velikosti 4GB a do něj si vkládat to, co potřebuješ A na zbytek flešky si dávat ostatní soubory, které není třeba šifrovat. Nebo můžeš zašifrovat úplně celou flešku. Možné je oboje.