Na webu, kde je zverejnovani do registru smluv je i nastroj na anonymizaci PDF. Zvladne to v existujicim PDF a vse mimo zacernene casti zustane textove, coz by pri vytisknuti, zacerneni a naskenovani nebylo

P.S. Ale koukám, že tam požadují příhlášení přes datovku, takže zřejmě nic.
https://anonymizace.gov.cz/

Takže by šlo použít nějaký online PDF editor, třeba:
https://tools.pdf24.org/cs/edit-pdf