...partition(1)\WINDOWS2

no, zamysli se zda je ten první systém v pořádku, a zda můžeš "WINDOWS2" oželet. pak bys nabootoval do prvního systému, a na adresář \WINDOWS2 použít kouzelné klávesy shift+del.
potom zrušit jeho záznam v boot.ini.

ale je pravděpodobné, že touto geniální dvojinstalací sis nadělal v potíže se závislostmi v registrech a v \program files, a taky guláš v profilech v C:\Documents and Settings.

pokud máš oddělený systémový a datový disk, je nejlepší tuto hrůzu na c: zformátovat (datové d: zůstane), a nainstalovat znovu. naneštěstí 99% lidí, kteří mají problém s instalací windows, nemají rozdělený disk a formát si nemohou dovolit.