Nechápu přesně kam míříš. Windows Defender stejně jako většina antivirů především kontrolují vše co se na počítači šustne - co se spouští, ukládá nebo načítá a to v reálném čase (pořád).
Což má za následek že chrání pořád ale zpomaluje pc.

Můžeš zkusit na testsouboru
https://www.eicar.org/?page_id=3950

Ta rychlá kontrola je víceméně doplňková věc takže podle mě není důležité jak často se spouští. Ale možná to sleduje změny nebo ukládá kontrolní součty nevím.