Certifikáty jsou uloženy v registrech. Pokud jsi je před tím nevyexportoval (nezazálohoval), pak si můžeš požádat o nové certifikáty.
Pokud máš zálohy i registrů (jsou to soubory) a máš čas, pak můžeš zkusit ty certifikáty z toho vydolovat
https://blog.nviso.eu/2019/08/28/extracting-certificates-from-the-windows-registry/