Po klonování by vše mělo fungovat jako před ním, pokud to je správně udělané. Diskgenius neznám, doporučil bych Acronis Trueimage nebo Macrium Reflect.
Hláška "Chyba grafické karty" - to sis nějak převyprávěl, ne? Screenshot by nebyl?
Můžeš taky kouknout do Prohlížeče událostí, jestli tam nějsou nějaké kritické chyby.