Pozice mezi soubory nezůstává vždy zachovaná. Všiml jsem si, že není problém zkopírovat všechny složky někam úplně jinam, přejmenovat složku, vložit "mezisložku" - odkaz se nenaruší. Mám-li ale v souboru Y hypertextový odkaz na soubor X uložený ve složce 1 a její podsložce 2, a poté soubor X např. přesunu do složky 1 prostřednictvím vyjmout-vložit, odkaz v Y směřuje k už neexistujícímu souboru, bez ohledu na to, zda mám nastaveno, aby odkazy byly relativní vzhledem k systému souborů. Ideální by bylo moci odkaz "navázat" na konkrétní soubor bez ohledu na to, zda bude přejmenován či přesunut, ale to už jsem vzdal. Stačilo by mi moci dohledat soubory s odkazem k určitému dokumentu, abych odkaz mohl v případě přejmenování či přesunu upravit.