V nastavení RDP připojení můžeš nechat po připojení namapovat lokální disky - je to volba v nastavení RDP připojení.
Otázkou je, zda to povolují vaše politiky (jestli to někdo nezakázal). Ale ty zálohy budou pomalé.

Jsi v jedné síti?
proč na zálohy nepoužíváte něco normálního, třeba i takový NAS by byl vhodný a pak pomocí RSYNC automaticky zálohovat pouze změny.