Pokud by to byl tento typ problému, tak bych u Androidu čekal především nativní podporu ext4/ext3, pak podporu pro nějaký *FAT* (pro SD karty a podobně) a až úplně někde na konci, pokud vůbec, pro NTFS.
Rozhodně pokud jde o disk do nějakého zařízení, tak je ideální (pokud to jde) ho jak dělit, tak formátovat v dotyčném zařízení, protože většinou ono samo ví, jak mu to nejlíp vyhovuje.