Technicky je zcela vyloučené, aby se soubory "prohodily". Vyžadovalo by to speciální postup (střídavé přesuny jednotlivých souborů) a celkem dost času.

Takže buď to tak bylo od začátku a disky byly blbě pojmenované nebo je to nějaký bordel se zástupci/linky ???

Tím přestrkáváním a šíbováním s písmenky jsi to dorazil ...

Takže disky postupně samostatně připojit jako externí, zjistit skutečný stav všech souborů na disku (nejen jméno adresáře) a disk správně pojmenovat v souladu s realitou (ať už se ti líbí nebo ne).

Potom je zapojit zpátky a přidělt vhodná písmena.

Nakonec to třeba můžeš i přeorganizovat. Jinak, nějaké "přestrkávání" systémových adresářů může taky způsobit zmatek, obzvlášť v kombinaci s písmenkama či nějakými linky (třeba i nevědomými).