Nevidím důvod, proč by to měl být problém. Hlavně si všechno o co nechceš přijít, zálohuj. Zálohování znamená, že máš všechna pro tebe důležitá data zkopírována někde úplně mimo na externím disku, teda máš minimálně jednu kopii online na počítači a minimálně jednu offline na externím disku, který trvale nepřipojuješ k PC.

Osobně teda vůbec s těma osobníma složkama nemanipuluju a nechávám vše na C:, tak jak jsou po instalaci. Na datovém disku si dělám vlastní složky tak, abych se v tom vyznal a měl i pořádek v tom, co mám a co právě nemám zálohované.