sloty na mb - myslíš pro sata disky?
nemá ta základní deska v tech.popisu uvedené konflikty mezi některými sata a m.2 nebo pcie pro grafiku?
ne, tak jediné omezení se tam týká slotu pcie4: https://cz.msi.com/Motherboard/B350-TOMAHAWK/Specification

* PCI_E4 slot will become PCIe 2.0 x2 mode, when installing device in any PCIe x1 slot.

ale jeden m.2 to má, kdežto ty využíváš asi jen sata.
že bys ten wd blue nahradil něčím veselejším: kingston kc3000, adata sx8200, možná samsung 970 evo, crucial p3 - ať si to nepřekáží.