To nevím, já mám stejný název souboru videa a souboru s titulky, jen maji jinou příponu. Fungovalo mně to vždy správně, ať už to byl VLC nebo PotPlayer. Samo se kódování nepřepne, pokud ho nastavíš manuálně. Chce si to s tím pár minut pohrát. Hlavně musí být stejný ten název. Pokud není, tak titulky musíš načíst manuálně.