ffmpeg.exe dej do Windows složky
Pak si vytvoř cmd soubor:

MD output
for %%i in (*.mp4) do ffmpeg -i "%%i" -acodec copy -c:v libx265 -crf 28 "output\%%i" 2>nul
pause

Pokud tento cmd soubor dáš do jakékoliv složky s mp4 a spustíš, tak vytvoří složku output a do ní ripy mp4 se zvolenými parametry, v tomto případě se použije softwarový kodek x265 (enkoduje do h265/hevc) a default crf 28, pokud chceš kvalitnější a větší ripy, zmenši to číslo, pokud méně kvalitní a menší tak zvětši to číslo.