Fasttrack není nutno vždy vypínat, záleží na tom, jak je to celé implementováno. Viz https://forum.mikrotik.com/viewtopic.php?t=113308
Prostě stačí ve forwardu přidat PŘED fasttrack pravidlo, který FT obejdeš pro pakety, které sis definoval a namangloval v mangle táblici.