No takhle, AutoGK má v instalačce XVID kodek. V AutoGK se zrovna (pokud se nešťouráš v advanced)nedá moc nastavit. Je možný, že instalací codec packů se nastavení XVID změnilo (profil,bitrate...).

Zkusil bych po veškerý odinstalaci:
AutoGK a v jeho instalaci i Xvid. Nic jinýho a zkusit jak to převoduje.