Píšeš, že chceš klonovat, v tom případě otázky 1.-3. nedávají smysl.

1. klonování = systémový disk se "zkopíruje" na jiný disk. Takže nechápu, proč mluvíš o nějaké složce a více verzích.
2. "150GB dat z 500GB disku zabere na cílovém disku 150GB nebo 500GB?" - když klonuješ, tak přece data na cílovém disku budou zabírat úplně stejně jako na původním (zdrojovém) disku. Kam by se vypařily? Nebo naopak odkud by přibyly?
3. když chceš dělat zálohu systémového disku, tak se používá image a ne klonování.