Napíšu tu svou domněnku.
Máš EFI s podporou NTFS.
Takže tam máš dvě možnosti na bootování, protože tvá EFI vidí jak bootx64.efi (ten od Rufus) na prvním oddílu s FAT32, tak i bootx64.efi (ten z instalačky Windows) na druhém oddílu s NTFS.
Pokud tomu tak opravdu je tak zvaž přímé používání NTFS oddílu (GPT disk) bez použití Rufus