např. to hlásilo, že je používán, i když nebyl), nezbylo než ho vytáhnout natvrdo

to je právě ten špatný případ, kdy se to nesmí vytáhnout. ale dají se korektně restartovat windows a přitom odpojit disk.

na odpojení takto se vzpírajících disků používám zástupce:

C:\Windows\System32\cmd.exe /c (C:\Windows\System32\taskkill.exe /im explorer.exe /f && start explorer.exe && dir C:\ /w /a:d)

ten poslední dir je tam pro aspoň nějakou malou pauzu, s ikonou "wifi" flashky.