Podle mých praktických zkušeností Absolute Uninstaler neškodí. Používám jej už dlouho právě kvůli pročištění registrů a ještě mne ani jednou nezklamal (na rozdíl od jiných). A po obnovení systému mi některé programy nebo zástupci příp. .exe soubory zmizí taky i když zbytek programu zůstane. Myslím, že to souvisí se zvoleným bodem obnovení. Ale jinak děláš zásadní chybu v tom, že si projekty a hotové věci ukládáš na systémový disk. Na to máš mít vyčleněný "pracovní" disk nebo oddíl.