Tak skus commandline prepinacom vynechat vsetky subory z toho adresara:
-x!ten_adresar\*
Vyskusaj si to najprv na nejakom malom mnozstve dat, a aj s podadresarmi ze ci bude ignorovat potom aj vsetky podadresare v tom ten_adresar (mal by), nech to nekompresujes 10hodin zbytocne :) To ze bude v archive jeden prazdny adresar snad nevadi.